История кафедры башкирской филологии неразрывно связана с историей факультета. Учителей башкирского языка и литературы готовили еще в 1940-х гг., когда на базе Стерлитамакского башкирского педагогического училища был открыт Стерлитамакский учительский институт и приняты первые 60 человек. В 1948-1949 учебном году кафедру башкирского языка и литературы возглавлял участник Великой Отечественной войны Абдулла Набиуллович Баязитов – преподаватель башкирского языка и методики его преподавания. В состав кафедры вошли преподаватели башкирского языка и литературы З.З. Утяшев, Б.Б. Тугузбаева В 1949-1951 гг. преподавателем по башкирской литературе работал Локман Хаким Габдрахманович Гиляжев, ставший потом известным поэтом и писателем, лауреатом Государственной премии им. С. Юлаева.
В 1951-1952 учебном году кафедрой языка и литературы, объединившей преподавателей башкирского языка и литературы, русского языка и литературы, иностранных языков, заведовала кандидат педагогических наук Фагима Гайфулловна Исламова.
Приказом института от 29 августа 1953 года кафедра языка и литературы была разделена на две: кафедру русского языка и литературы и кафедру башкирского языка и литературы, последней продолжала руководить Ф.Г. Исламова. В состав кафедры вошли преподаватели А.Н. Баязитов, К.К. Муксинова.
В 1954 году, когда учительский институт был реорганизован в Стерлитамакский государственный педагогический институт, отделение башкирского языка и литературы соединилось с отделением русского языка и литературы.
Приказом института №50 от 30 марта 1962 года кафедра языка и литературы была разделена на две: кафедру языка и кафедру русской и зарубежной литературы. В состав кафедры языка вошли преподаватели русского, иностранного и башкирского (Х.Г.Юсупов, Р.Х.Халикова) языков.
Приказом Министерства просвещения РСФСР №5-198 от 11 июня 1966 г. в СГПИ была организована кафедра башкирского языка и литературы, на которой работали 4 преподавателя: доц. Х.Г. Юсупов, Р.Х. Халикова, ст. преп. И.Г. Валитов, асс. Т.А. Биккузина. Заведующей назначена и.о. доц. Раиса Халиловна Халикова.

Р.Х.Халикова
С 1967 г. до 1970 г. кафедру башкирского языка и литературы СГПИ возглавил доцент Харрас Галиакберович Юсупов. Следует отметить, что огромная роль в создании кафедры принадлежит декану историко-филологического факультета Х.Г. Юсупову и первому заведующему Р.Х. Халиковой. Благодаря их организаторским способностям, умению сплотить вокруг себя коллектив единомышленников стало возможным создание перспективной кафедры. В эти годы кафедра пополнилась выпускниками Башкирского государственного университета: М.А. Ишкильдиной (1967 г.), Д.С. Тикеевым (1967 г.), Г.Г. Кагармановым (1969 г.).
Х.Г.Юсупов
В 1970-1975 годы заведование осуществлял выпускник факультета, лауреат премии Башкирского комсомола им. Г. Саляма, кандидат филологических наук, доцент Салават Ахмадеевич Галин (1934-2010), который был направлен из ИИЯЛ БФ АН СССР по рекомендации обкома с целью укрепления кадров. При нем начался пересмотр учебных планов, увеличилось количество часов на различные дисциплины и читаемые курсы. Было открыто заочное башкирско-русское отделение, в результате появились новые вакансии, в связи с чем на работу были приглашены кандидат филологических наук Э.Ф. Ишбердин, Х.А. Тулумбаев, Б.Б. Гафаров, Л.Л. Рахматуллина (Самигуллина), Р.Ф. Ильясов, К.Г. Ишбаев. С 1975 по 1987 гг. С.А. Галин работал проректором по научной работе института. В последующем он стал доктором филологических наук, профессором, членом Академии гуманитарных наук РФ.
С.А.Галин
С 1975 года по 1987 годы кафедру башкирского языка и литературы возглавляет доцент Ишбулды Гиниятович Валитов. В 70-80-х годах в результате интенсивной научной работы резко повысился процент остепененных преподавателей кафедры: один за другим защитили кандидатские диссертации Т.А. Биккузина, И.Г. Валитов, Д.С. Тикеев, Б.Б. Гафаров, Г.Г. Кагарманов, Л.Л. Самигуллина (Рахматуллина). Кафедра башкирского языка и литературы в эти годы значительно окрепла.
И.Г.Валитов
Кафедра всегда работала в тесном сотрудничестве с учеными Башкирского государственного университета и Института истории, языка и литературы УНЦ РАН. Для чтения спецкурсов в разные годы приглашались доктора филологических наук, профессора Дж.Г.Киекбаев, Г.Б.Хусаинов, Г.Г.Саитбатталов, М.В.Зайнуллин, З.Г.Ураксин, Р.Н.Баимов. Преподаватели кафедры постоянно изучали состояние преподавания родного языка и литературы в школах республики.
В 1987-2008 гг. заведовал кафедрой Данис Султанович Тикеев, доктор филологических наук, профессор, Почетный работник высшего профессионального образования РФ, член-корреспондент Академии социальных и педагогических наук РФ, Заслуженный деятель науки РБ.
Д.С.Тикеев
В 1987-2008 гг. заведовал кафедрой Данис Султанович Тикеев, доктор филологических наук, профессор, Почетный работник высшего профессионального образования РФ, член-корреспондент Академии социальных и педагогических наук РФ, Заслуженный деятель науки РБ.
В 2008-2011 гг. заведовала кафедрой Зугура Идрисовна Саляхова.
С 1997 года при кафедре башкирского языка успешно функционирует аспирантура по специальностям: «10.02.02 – Языки народов РФ (башкирский язык)» и «13.00.02. – Теория обучения и воспитания (башкирский язык и литература)», что явилось значительным событием в истории развития кафедры и вуза.
По рекомендации аттестационной комиссии в сентябре 2004 года кафедра башкирского языка и литературы была разделена на две: кафедру башкирского языка (заведующий кафедрой – доктор филологических наук Д.С. Тикеев) и кафедру башкирской литературы (заведующая кафедрой – доцент, кандидат филологических наук Р.Х. Илишева).
С 2004 по 2012 гг. кафедру башкирской литературы возглавляла кандидат филологических наук, доцент, Почетный работник высшего профессионального образования РФ, Отличник образования РБ Райса Хакимовна Илишева.

Р.Х.Илишева
С 2012 по 2016 гг. заведующей кафедрой башкирской литературы являлась Фаткуллина Рита Харисовна, кандидат филологических наук, доцент, Отличник образования РБ, номинант межрегионального конкурса «Учитель башкирского языка и литературы – 2004», член Союза писателей РФ и РБ.
Р.Х.Фаткуллина
В 2016 гг. кафедру башкирской литературы возглавлял Утяев Айнур Фанисович, кандидат филологических наук, доцент, автор поэтических сборников «Пыл сердца» (2001), «Белые ночи» (2006).
А.Ф.Утяев
С 2011 по 2017 гг. кафедрой башкирского языка руководила Хусаинова Ляйля Мидхатовна, кандидат филологических наук, доцент, член жюри межрегиональных конкурсов «Учитель года башкирского языка и литературы» (2009-2013), городских конкурсов «Педагог года» (2011-2015); награждена Почетной грамотой Министерства образования и науки РФ.
Л.М.Хусаинова
С сентября 2017 года кафедра башкирского языка и кафедра башкирской литературы были объединены в кафедру башкирской филологии, которую возглавляет Зугура Идрисовна Саляхова, доктор филологических наук, профессор, Отличник образования РБ, победитель регионального и зонального конкурса “Учитель башкирского языка и литературы – 1997”, открытого республиканского смотра-конкурса “Учебные и воспитательные методические комплексы” (2002).
З.И.Саляхова
В состав кафедры башкирской филологии входят: доктор филологических наук Абуталипова Р.А., кандидаты филологических наук: Арсланова М.С., Басырова Г.А., Илишева Р.Х., Киреева Л.Р., Утяев А.Ф., Хусаинова Л.М., Фаткуллина Р.Х.; кандидаты педагогических наук: Аккужина Ф.А., Гайнуллина Ф.Б.
Имея статус выпускающей, в настоящее время кафедра готовит бакалавров по направлению «Педагогическое образование» с двумя профилями подготовки «Родной (башкирский) язык и литература, Иностранный язык» (очная форма обучения); «Педагогическое образование» с двумя профилями подготовки «Родной (башкирский) язык и литература, История» (очная форма обучения); по направлению «Педагогическое образование» двумя профилями подготовки «Родной (башкирский) язык и литература, Русский язык» (очная и заочная форма обучения); «Педагогическое образование» «Родной (башкирский) язык и литература» (заочная форма обучения).
При кафедре башкирской филологии функционирует магистратура по направленности «Современные научные парадигмы и инновационные образовательные технологии в филологии», а также аспирантура по направленности «Языкознание и литературоведение: языки народов РФ (башкирский язык). В настоящее время аспиранты под руководством доктора филологических наук, профессора Саляховой З.И. работают над диссертациями на соискание ученой степени кандидата филологических наук по специальности 10.02.02 – языки народов РФ (башкирский язык) по актуальным проблемам башкирского языкознания.
Главная цель работы кафедры – дать молодому поколению конкурентоспособное по качеству, полноценное образование. В связи с этим, особое внимание уделяется научно-исследовательской работе студентов. Неоднократные победы молодых исследователей на республиканских, всероссийских и международных конференциях, всероссийских олимпиадах, конкурсах демонстрирует о высоком научно-методическом уровне их работ. Так, например, с 2009 года ежегодно членами кафедры готовится команда студентов для участия во Всероссийской студенческой олимпиаде «Филология. Языки и литература народов России», проходившей в Горно-Алтайском университете. Студенты ежегодно занимают призовые места, становятся победителями в различных номинациях.
Выпускные квалификационные работы, курсовые работы, выполняемые студентами факультета под руководством преподавателей кафедры, отражают основные исследовательские направления научной деятельности кафедры. Результатом успешной научно-исследовательской работы студентов являются регулярные публикации их статей и тезисов в материалах конференции, научных сборниках.
Доброй традицией стало проведение при кафедре башкирской филологии ежегодных международных, всероссийских, вузовских научно-практических конференций «Тюркская филология: современные подходы в исследованиях молодых ученых», «Филологические науки: взгляд молодого ученого”, “Актуальные проблемы тюркской филологии”. Выпускаются научно-методические сборники: “Актуальные проблемы обучения башкирскому языку и литературе в условиях перехода на новые образовательные стандарты», «Современные технологии в образовании: школа-вуз”, сборник международного онлайн семинара «Насущные проблемы тюркской филологии” совместно с Актюбинским государственным университетом им. К. Жубанова.
Члены кафедры, аспиранты, магистранты и студенты активно участвуют в грантовой деятельности.
Кафедра башкирской филологии уделяет большое внимание работе с одаренными студентами в области литературного творчества. При кафедре организовано литературно-творческое объединение «Ашкадар», которое имеет давние традиции. Данный кружок был основан Х.Гиляжевым в 50-х годах прошлого столетия. Многие бывшие кружковцы впоследствии были приняты в члены Союза писателей РБ и РФ, стали учеными-филологами, журналистами. В настоящее время руководителем кружка является кандидат филологических наук, доцент Утяев А.Ф.
Членами кафедры регулярно проводятся литературные вечера, посвященные творчеству поэтов и писателей Башкортостана, организуются встречи с видными деятелями искусства, творческие конкурсы, олимпиады, семинары.
Кафедра башкирской филологии является ведущим учебным и научно-методическим центром южного региона республики, готовящим педагогов для различных форм образовательных учреждений. Работая в тесном сотрудничестве с общеобразовательными учреждениями, регулярно проводятся совместные научно-практические конференции, олимпиады, творческие конкурсы, литературные вечера, посвященные творчеству поэтов и писателей Башкортостана, организуются встречи с видными деятелями искусства, различные воспитательные мероприятия, круглые столы и семинары. Преподаватели кафедры, а также магистранты и студенты активно участвуют в организации и проведении конференций «Ломоносовские чтения» в гимназии №1, «Киекбаевские чтения» в гимназии №3 им. Джалиля Киекбаева, «Ибрагимовские чтения» в гимназии №5 (г. Стерлитамак); «Валидовские чтения» в башкирской гимназии-интернат №2 им. Ахметзаки Валиди (г. Ишимбай).
Должное внимание уделяется воспитательной работе со студентами. Ко всем академическим группам студентов прикреплены кураторами преподаватели кафедры, которые ведут со своими подопечными постоянную работу с 1 курса до окончания университета.
Большое внимание уделяется международному, межрегиональному и межвузовскому сотрудничеству. Кафедра тесно сотрудничает с вузами республики (БашГУ, БГПУ им. Акмуллы и др.). Организована активная работа по международному сотрудничеству с Карагандинским университетом «Болашак» (г. Караганды, Республика Казахстан), Актюбинским региональным государственным университетом им. К.Жубанова (г. Актобе, Республика Казахстан), с Горно-Алтайским государственным университетом (г. Горно-Алтайск, Республика Алтай).
На кафедре башкирской филологии создана подлинно творческая атмосфера для плодотворной учебно-методической, научно-исследовательской и воспитательной деятельности всего коллектива.